Men allt eftersom historien fortskrider uppstår spänningar när en utvald grupp grisar börjar manipulera och utnyttja sina meddjur. Konflikten intensifieras när grisarna, ledda av den listiga och auktoritära galten Napoleon, börjar modifiera de sju budorden – gårdens vägledande principer – för att tjäna sina egna intressen.
Napoleon och hans medgrisar antar gradvis ledarroller och etablerar ett hierarkiskt system som sätter dem över de andra djuren. Detta leder till en djup klyfta inom djursamhället, eftersom Napoleon och hans hantlangare åtnjuter privilegier och lyx medan resten av djuren sliter för gårdens underhåll.
Konflikten kretsar kring grisarnas jakt på makt och de andra djurens kamp för att upprätthålla idealen för deras initiala uppror. I slutändan blir Animal Farms utforskning av utmaningarna för att främja verklig jämlikhet en kritik av totalitära samhällen och korruptionen av till synes ädla ideologier.