Efter att Voldemort dödat professor Dumbledore i Fenixorden, blir Snape potionslärare och rektor på Hogwarts. Trots hans hårda och ibland grymma karaktär har läsarna förstått Snapes lojalitet till Dumbledore, och hans roll som dubbelagent för Fenixorden.
I Deathly Hallows blir Snapes lojalitet återigen ett mysterium, eftersom han villigt ger Voldemort information om Harrys plats. Harry, som tror att Snape är hans fiende, jagar efter honom när han ser honom och professor McGongall fly under slaget vid Hogwarts.
Det är Nagini, Voldemorts orm, som dödar Snape med ett bett i nacken. Medan han dör, använder Snape sin sista kraft för att trolla fram minnen han delade med Harry. Det är genom dessa minnen som Harry äntligen lär sig sanningen om Snapes karaktär, och upptäcker att hans lojalitet inte var till Voldemort, utan till Lily och Dumbledore, och att hans handlingar drevs av en tragisk och obesvarad kärlek som slutade med Lilys död.