* Farorna med hybris: Bröderna Elrics försök att använda alkemi för att återuppliva sin mor leder till deras egen stympning, som lyfter fram de potentiella farorna med okontrollerad ambition och att söka kunskap utan att förstå dess fulla implikationer.
* Sökandet efter sanning: Serien utforskar sanningens natur och hur den kan förvrängas eller manipuleras, särskilt inom ramen för militären och State Alchemist-programmet.
* Vikten av mänsklig koppling och empati: Serien betonar värdet av mänskliga relationer och hur de kan hjälpa individer att navigera i komplexiteten i sina egna upplevelser. Detta är uppenbart i de starka banden mellan bröderna Elric, såväl som de olika relationer de skapar under hela sin resa.
* De etiska konsekvenserna av vetenskapliga framsteg: Fullmetal Alchemist brottas med de etiska dilemman som ställs av kraftfull teknik, som alkemi, och risken för missbruk. Det uppmuntrar publiken att tänka på det ansvar som följer med kunskap och dess tillämpningar.
I slutändan föreslår serien att även om jakten på kunskap är värdefull, måste den balanseras med visdom, empati och en djup förståelse för dess potentiella inverkan på världen och de omkring oss.