- Ät, drick och var hälsosam:Harvard Medical School Guide to Healthful Eating (2001)
- Nutritional Epidemiology, 3:e upplagan (2013) (samredigerad med Meir Stampfer)
- Willett's Nutritional Epidemiology, andra upplagan (2018) (redigerad av Willett)
- The Salt Sugar Fat Fix:How the Food Giants Hooked Us (2020) (samförfattare med Marion Nestle)
Utöver dessa böcker har Walter Willett publicerat vetenskapliga artiklar, recensioner och policyrekommendationer i olika medicinska och näringsmässiga tidskrifter.