Större antagonister:
* Magneto: Den mest ikoniska X-Men-skurken, Magneto, är en kraftfull mutant med förmågan att manipulera magnetism. Han tror att mutanter är överlägsna människor och borde styra världen, ofta i konflikt med professor X:s dröm om fredlig samexistens.
* Apokalyps: En kraftfull, uråldrig mutant med förmågan att absorbera andras krafter, Apocalypse försöker rena världen och skapa en ny ordning med sig själv som sin härskare.
* Sabeltand: En vild och brutal mutant med förbättrade sinnen, övermänsklig styrka och regenerativa förmågor, Sabertooth är ett obevekligt rovdjur och en svuren fiende till Wolverine.
* Mystik: Mystique är en mästare på att ändra form och bedrägeri, en skicklig spion och lönnmördare som ofta opererar i skymundan. Hon har ett komplext förhållande till X-Men, ibland agerar hon som en allierad och andra gånger som en hänsynslös fiende.
* Mutanternas brödraskap: En grupp mutanter ledda av Magneto som tror att människor är fienden och mutanter måste styra. Denna grupp har inkluderat många medlemmar genom åren, inklusive Toad, Pyro och Blob.
Andra anmärkningsvärda motståndare:
* Mr. Sinister: En briljant men hänsynslös genetiker som är besatt av att manipulera mutant evolution.
* The Juggernaut: En ostoppbar naturkraft med enorm styrka och osårbarhet.
* The Sentinels: Kraftfulla robotar designade för att jaga och förstöra mutanter.
* The Hellfire Club: En exklusiv och kraftfull organisation som försöker kontrollera mutanta krafter för sina egna syften.
* William Stryker: En militärledare som tror att mutanter är ett hot mot mänskligheten och försöker eliminera dem.
Organisationer:
* AIM (Advanced Idea Mechanics): En vetenskaplig organisation som ofta sysslar med farlig teknik och har stött ihop med X-Men vid flera tillfällen.
* Hydra: En global terroristorganisation med en historia av att försöka kontrollera mutanta krafter.
* The Purifiers: En fanatisk grupp människor som tror att mutanter är en pest över världen.
Det är viktigt att notera att X-Men har mött många andra motståndare under sin långa historia, men dessa är några av de mest anmärkningsvärda och återkommande fienderna. X-Mens fiender återspeglar de komplexa teman som fördomar, rädsla och kampen för jämställdhet som är vävda genom hela franchisen.