Mordet på Orientexpressen fördjupar sig i temat identitet och dess komplexitet. Romanen presenterar flera karaktärer med olika bakgrunder, kulturer och agendor, som var och en döljer en dold identitet eller bär på hemligheter. Poirot, detektiven, måste se bortom ytan för att fastställa passagerarnas sanna karaktärer och motiv.
Temat rättvisa spelar också en betydande roll i berättelsen. Poirot försöker inte bara lösa brottet utan också att se till att rättvisa skipas. Passagerarna står inför ett etiskt dilemma när de går samman för att avgöra mördarens öde. De måste avgöra om de ska följa strikta juridiska förfaranden eller ta saken i egna händer för att uppnå en känsla av rättvisa som de anser är nödvändig.
Romanen väcker spännande frågor om komplexiteten i mänsklig identitet, moralens tvetydighet och strävan efter sanning och rättvisa.