Josquins musik omfattar de flesta genrer som var aktuella under slutet av 1400-talet och början av 1500-talet. Idag är han mest känd för sina mässor och motetter, av vilka många betraktas som mästerverk av renässanspolyfonin, men under sin livstid var han förmodligen lika uppskattad som en kompositör av chansons; ett sjuttiotal inställningar överlever, mer än någon annan kompositör på sin tid. Josquins musik var känd i hela det utbildade Europa, och han blev en av de första allmänt kända kompositörerna sedan antiken.