Här är några av Bachs mest kända kompositioner för varje instrument:
Clavier:
- The Well-Termpered Clavier (två uppsättningar preludier och fugor i alla 24 dur- och molltonarter)
- Goldberg-variationer
- Franska sviter
- Engelska sviter
- Partitas
- Uppfinningar och Sinfonier
Orgel:
- Toccata och fuga i d-moll
- Preludium och fuga i E-dur
- Fantasi och fuga i g-moll
- Passacaglia och fuga i c-moll
- Koralpreludier
Fiol:
- Sonater och partitor för soloviolin
- Dubbelfiolkonsert
- Violinkonserter nr 1 och 2
Viola da gamba:
- Sex sviter för Viola da Gamba
- Sonater för Viola da Gamba och cembalo
Cello:
- Sex sviter för cello
- Cellokonserter nr 1 och 2
- Cellosviter
Flöjt:
- Flöjtsonater
- Flöjtkonserter
Oboe:
- Obokonserter
- Obosonater
Fagott:
- Fagottkonsert
- Fagottsonater
Trompet:
- Brandenburgkonsert nr 2
- Trumpetkonsert i D-dur
Trombon:
- Brandenburgkonsert nr 1
- Koralpreludier med tromboner
Bachs kompositioner inkluderar också många vokala verk, såsom kantater, motetter, passioner och oratorier. Några av hans mest kända sångverk inkluderar:
- Matteuspassionen
- Johannespassionen
- Mässa i h-moll
- Magnificat
- Juloratoriet
- Påsk Oratorium