Genom hela låten refererar Bieber till begreppet bön som ett kraftfullt verktyg för att få kontakt med en högre makt och finna frid i tider av osäkerhet. Texterna utforskar idén om att nå ut till Gud för hjälp, tröst och styrkan att övervinna hinder.
Låten berör också temat mänsklig sårbarhet. Bieber erkänner sina egna svagheter och tyngden av hans kamp, men han uttrycker också en känsla av hopp och tro inför motgångar. Texterna antyder att bön ger honom en känsla av inre styrka och motståndskraft, vilket gör att han kan möta utmaningar med mod och uthållighet.
Sammantaget förmedlar låten "Pray" budskapet om att söka andligt stöd och vägledning under svåra tider, och att finna tröst och styrka genom bön. Det betonar trons kraft och tron på att vända sig till en högre makt kan hjälpa individer att övervinna personliga strider och hitta hopp mitt i utmaningar.