Genom hela låten målar Tankian upp en levande bild av känslomässig isolering, där individer är fångade i sina separata verkligheter, oförmögna att verkligen nå eller förstå varandra. Han använder bilder av fysiska utrymmen, såsom tomma hem och karga landskap, för att spegla den tomhet som känns inom.
Dessutom överväger han effekten av teknik och ytliga kopplingar, och lyfter fram hur trots att han lever i en tid av konstant kommunikation, finns det fortfarande en ihålighet i mänskliga interaktioner.
I slutändan är "Empty Walls" en uppmaning till djupare, genuina kopplingar, ett uttryck för önskan att bryta sig loss från de känslomässiga väggar som skiljer människor åt och omfamna en mer tillfredsställande mänsklig upplevelse. Det fungerar som en kraftfull påminnelse om betydelsen av att främja meningsfulla relationer och vårda den känslomässiga aspekten av våra liv.