Nedbrytning av organiskt material: Musikinstrument och andra föremål relaterade till musik, som trummor, flöjter och skallror, är ofta gjorda av organiska material som bryts ner med tiden. Detta gör det svårt att hitta och studera dessa artefakter.
Kulturella förändringar och migrationer: När kulturer utvecklas och migrerar förändras också deras musiktraditioner. Detta gör det svårt att spåra musikens utveckling över tid, särskilt när det saknas skrivna skivor.
Begränsningar för arkeologiska bevis: Arkeologiska utgrävningar kan ge vissa insikter i tidiga kulturers musikaliska praktiker, såsom upptäckten av musikinstrument eller skildringar av musiker inom konst. Dessa fynd kan dock vara fragmentariska och kanske inte ge en fullständig bild av deras musiktraditioner.
Subjektiva tolkningar: Vid tolkning av arkeologiska bevis eller historiska berättelser kan forskare göra subjektiva bedömningar om innebörden och betydelsen av dessa fynd. Detta kan leda till olika tolkningar och meningsskiljaktigheter bland forskare.
Sekretess och exklusivitet: Vissa musikaliska metoder kan ha hållits hemliga eller begränsade till vissa grupper av människor i ett samhälle, vilket gör det svårt för utomstående att lära sig om dem.