* "El crimen de Cuenca" (1982), en historisk roman om ett rättegångsfel i början av 1900-talet.
* "La hija de la española" (1994), en historisk roman om livet för en spansk kvinna som emigrerar till Argentina på 1800-talet.
* "El caballero del jubón amarillo" (2001), en historisk roman om livet för Juan de la Cruz, en spansk mystiker från 1500-talet.
* "El sueño del Inca" (2006), en historisk roman om livet för Tupac Amaru II, en inkaledare från 1700-talet som ledde ett uppror mot spanjorerna.
* "La vida amorosa de Federico García Lorca" (2011), en biografi om den spanska poeten Federico García Lorca, med fokus på hans relationer med män.
Förutom sina romaner har Ballesteros också skrivit flera fackböcker, inklusive:
* "La historia del Madrid" (1989), en historia om den spanska huvudstaden.
* "La España del descubrimiento" (1992), en historia av Spanien under upptäcktstiden.
* "La América española" (1995), en historia av Latinamerika.
Ballesteros verk har översatts till mer än 20 språk, och han har vunnit många priser för sitt författarskap, inklusive Premio Nacional de Narrativa (1982), Premio Planeta (1994) och Premio Alfaguara (2006). Han är medlem i Real Academia Española, den spanska kungliga akademin.