1. Samla de sju Chaos Emeralds: Dessa är utspridda över spelets nivåer, och du behöver alla för att nå den sista striden.
2. Möt mot Dark Gaia i slutet av spelet: Efter att ha samlat alla sju Chaos Emeralds kommer du att möta Dark Gaia i sin sanna form, en massiv, flerhövdad best.
3. Använd Chaos Emeralds kraft: Du kommer att använda den kombinerade kraften från Emeralds för att rena Dark Gaia. Detta innebär att du använder "Super Sonic"-formuläret, som låses upp genom att samla alla sju Chaos Emeralds.
4. Utför reningen: I Super Sonic-form kommer du att släppa lös en kraftfull attack mot Dark Gaia. Denna attack dödar inte Dark Gaia utan renar den, återställer balansen i världen och återställer den till sin ursprungliga form.
Spelets berättelse fokuserar på idén om återställning snarare än direkt dödande. Dark Gaia, även om den är destruktiv, är i slutändan en del av världens balans, och målet är att återföra den till sin rättmätiga plats.