Planen börjar med att Cyrus utnyttjar kraften hos den kraftfulla legendariska Pokémon Cresselia och Darkrai. Cresselia sägs kontrollera månens kraft och kan ge önskningar, medan Darkrai förknippas med mörker och mardrömmar. Genom att kombinera sina förmågor, tänker Cyrus skapa Distortion World och förändra verkligheten.
För att sätta sin plan i rörelse söker det galaktiska imperiet kontroll över Sinnoh-regionen, där Cresselia och Darkrai sägs bo. De etablerar olika baser i hela Sinnoh och engagerar sig i strider mot spelarkaraktären och deras lag. Ett av deras anmärkningsvärda gömställen är Galactic HQ i Veilstone City, som fungerar som det huvudsakliga navet för deras verksamhet.
När spelaren går vidare genom spelet möter de medlemmar av det galaktiska imperiet och reder ut sina planer. Det klimaktiska ögonblicket inträffar när spelaren når Team Galactics hemliga gömställe, Spear Pillar, där Cyrus försöker skapa Distortion World.
Spelaren måste möta utmanande strider mot Galactic Grunts, Commanders och till och med Cyrus själv. Om han lyckas med att besegra Cyrus kan spelaren i slutändan förhindra fullbordandet av hans plan och återställa freden i Sinnoh-regionen.
Den geniala planen i Pokemon Light Platinum fungerar som den centrala berättelsen som driver spelets handling och sätter scenen för ett episkt äventyr fyllt av strider, pussel och möten med legendariska Pokémon.