Denna svårighet är den enklaste i spelet, och den anses generellt vara mer förlåtande än de andra svårighetsnivåerna. Fiender är mindre aggressiva och har mindre hälsa, och spelet ger spelaren fler liv och fortsätter.
Svårt:Denna svårighet är mer utmanande än Normal, men den är fortfarande relativt förlåtande. Fiender är mer aggressiva och har mer hälsa, och spelet ger spelaren färre liv och fortsätter.
Mycket svårt:Det här är den mest utmanande svårighetsnivån i spelet, och det är väldigt oförlåtande. Fiender är extremt aggressiva och har mycket hälsa, och spelet ger spelaren väldigt få liv och fortsätter. Denna svårighet rekommenderas inte för nybörjare eller tillfälliga spelare.
Utöver de tre huvudsakliga svårighetsnivåerna finns det även ett antal hemliga svårigheter som kan låsas upp i spelet. Dessa hemliga svårigheter är ännu mer utmanande än Very Hard svårigheten, och de rekommenderas inte för någon annan än de mest erfarna Sonic Heroes-spelarna.