Han har dock upplevt flera nära-döden-upplevelser och har dödats i alternativa tidslinjer och berättelser :
* The Clone Saga (1994-1996): Denna ökända story såg Spider-Man till synes dö och ersättas av en klon, även om detta så småningom visade sig vara ett bedrägeri.
* "En dag till" (2007): I den här berättelsen gör Spider-Man en överenskommelse med Mephisto för att rädda moster Mays liv, men till priset av att radera hans äktenskap med Mary Jane Watson från existens.
* "The Death of Spider-Man" (2004): Detta var en separat kontinuitet, utanför Marvels huvuduniversum, där Spider-Man dödades av Green Goblin.
* "Spider-Man:Reign" (2007): Denna framtida tidslinje såg en äldre, trött Spider-Man dö efter en sista strid med Green Goblin.
Det är viktigt att notera att dessa är specifika fall och inte gäller Marvels huvuduniversum. Medan Spider-Man har mött många utmaningar och tragedier, fortsätter han att vara en ikonisk hjälte i Marvel-universumet.