I Shrek den tredje är Shrek och Fiona på väg att bli föräldrar. Men innan de kan slå sig ner avbryts de av en budbärare från Far Far Away. Budbäraren informerar dem att kung Harold har gått bort och att Shrek är nästa i tronföljden.
Shrek är ovillig att ta på sig rollen som kung, men han håller så småningom med. Han, Fiona och Donkey ger sig av till Far Far Away, där de möts av fientlighet av medborgarna. De konfronteras också av Prince Charming, som är fast besluten att ta över kungariket för sig själv.
Med hjälp av sina vänner kan Shrek besegra Prince Charming och rädda kungariket. Han lär sig också att han är en bra far och att han kan vara en bra kung.
Förutom huvudhistorien har Shrek den tredje också ett antal subplotter. Dessa underintriger inkluderar äventyren från Donkey and Puss in Boots, såväl som den onda häxans försök att återuppliva sin man, Lord Farquad.
Shrek the Third är en rolig och underhållande film som säkerligen kommer att glädja fans av Shrek-serien. Det är en berättelse om familj, vänskap och vikten av att vara sann mot sig själv.