Förstärkare:Dessa är DNA-sekvenser som binder transkriptionsfaktorer och främjar transkriptionen av närliggande gener. Till exempel är förstärkaren i immunglobulinets tunga kedjas locus ansvarig för den höga nivån av uttryck av dessa gener i B-celler.
Promotorer:Dessa är DNA-sekvenser som binder RNA-polymeras och initierar transkriptionen av gener. Till exempel är promotorn i genen för humant tillväxthormon ansvarig för uttrycket av denna gen i hypofysen.
Ljuddämpare:Dessa är DNA-sekvenser som binder transkriptionsfaktorer och undertrycker transkriptionen av närliggande gener. Till exempel är ljuddämparen i den humana β-globingenen ansvarig för undertryckandet av denna gen i icke-erytroida celler.
Transagerande sekvenser:
Transkriptionsfaktorer:Dessa är proteiner som binder till cis-verkande sekvenser och reglerar transkriptionen av gener. Till exempel binder transkriptionsfaktorn Oct-1 till oktamermotivet i immunglobulins tungkedjeförstärkare och främjar transkriptionen av dessa gener i B-celler.
RNA-polymeras:Detta är ett proteinkomplex som binder till promotorer och transkriberar gener till RNA.
Andra regulatoriska proteiner:Dessa är proteiner som binder till cis-verkande sekvenser och reglerar transkriptionen av gener på olika sätt. Till exempel binder proteinet CTCF till CCCTC-motivet i den humana β-globingenen och hjälper till att organisera kromatinstrukturen i denna region, vilket är nödvändigt för att förtrycka genen i icke-erytroida celler.