Istället har varje avsnitt vanligtvis ett annat mordfall som ofta involverar en unik och övertygande mördare. Det finns återkommande karaktärer som fungerar som skurkar i flera avsnitt, men de är inte huvudfokus för serien.
Några av de mest minnesvärda återkommande skurkarna inkluderar:
* Gravedigger: En seriemördare som begraver sina offer i utarbetade, ritualistiska gravar.
* Puppeteer: En seriemördare som manipulerar sina offer för att döda sig själva.
* Gormogon: En seriemördare som lämnar kryptiska meddelanden och gåtor för teamet att lösa.
Fokus för showen är främst på förhållandet mellan Dr. Temperance Brennan och Special Agent Seeley Booth och processen att lösa de mysterier som presenteras i varje avsnitt.