Showen utforskade ofta teman för fördomar, rasism och intolerans, men den behandlade aldrig direkt Förintelsen. Detta berodde troligen på showens tidsperiod (1959-1964), eftersom Förintelsen var ett mycket nyligen och känsligt ämne som många fortfarande kämpar med.
Det finns emellertid några avsnitt som kan tolkas som att ha tangentiella anslutningar till Förintelsen, till exempel:
* "Monsterna beror på Maple Street" (1960): Det här avsnittet utforskar rädsla, paranoia och farorna med mob mentalitet, som är teman som resonerar med händelserna i Förintelsen.
* "The Invaders" (1962): Det här avsnittet har en främmande invasion som riktar sig till människor baserat på deras skillnader, som kan ses som en metafor för förföljelse och intolerans.
Det är viktigt att komma ihåg att Twilight Zone var en produkt från sin tid, och det är svårt att bedöma den enligt dagens standarder. Emellertid har dess utforskning av teman som fördomar och rädsla fortfarande relevans idag.