Spänningen ökar när Thomas och hans vänner står inför sina största utmaningar hittills. De måste navigera genom labyrintens förrädiska korridorer samtidigt som de förföljs av de obevekliga Grievers, mekaniska varelser som strövar omkring i labyrinten och utgör ett dödligt hot. Klimaxen når sin höjdpunkt när Thomas konfronterar labyrintens skapare, Ava Paige, och ifrågasätter moralen och motiven bakom WCKD:s experiment.
Mitt i kaos och fara avslöjar Thomas och Gladers hemligheterna bakom labyrinten och orsakerna till deras instängdhet. De kommer överens med de uppoffringar de måste göra för att bryta sig loss och avslöja sanningen om WCKD:s avsikter.
The Maze Runners klimax präglas av intensiva actionsekvenser, känslomässiga konfrontationer och avslöjanden som förändrar historiens gång och sätter scenen för händelserna att utspela sig i de efterföljande böckerna i serien.