Vetenskapliga utmärkelser:
* Copley-medalj (1874) :Tilldelas av Royal Society of London, en av de mest prestigefyllda vetenskapliga utmärkelserna i världen, för sitt arbete med jäsning och bakterieteorin om sjukdomar.
* Rumford-medalj (1874) :Tilldelad av Royal Society of London för sin forskning om polarisering av ljus och dess tillämpningar.
* Albert-medalj (1881) :Tilldelas av Royal Society of Arts, för hans bidrag till folkhälsa och förebyggande av sjukdomar.
* Knight of the Legion of Honor (1853) :En prestigefylld fransk utmärkelse, tilldelad till personer som har gjort betydande insatser för nationen.
* Hederslegionens Storkors (1881) :Den högsta rangen i Legion of Honour, som erkänner Pasteurs exceptionella prestationer.
* Medlem av den franska vetenskapsakademin (1862) :En av de högsta vetenskapliga utmärkelserna i Frankrike.
* Utländsk medlem av Royal Society (1869) :En ära att erkänna hans bidrag till vetenskap utanför Storbritannien.
Andra utmärkelser:
* Franska vetenskapsakademins pris (1856) :Prisbelönt för sitt arbete med jäsning.
* Pris från vetenskapsakademin i Paris (1862) :Tilldelas för sitt arbete med bakterieteorin om sjukdomar.
Utöver dessa specifika utmärkelser fick Pasteur också många andra utmärkelser och erkännanden under sin karriär, vilket befäste hans arv som en av 1800-talets mest inflytelserika vetenskapsmän.