- Newbery Medal for Fiction 2005 för The Spiderwick Chronicles
- Eisner Award för bästa författare/artist 2006 för The Coldest Girl in Coldtown
- Edgar Award för bästa unga vuxna 2011 för White Cat
- Nebula Award för bästa novell 2012 för "The Girl Who Drank the Moon"
- World Fantasy Award för bästa roman 2019 för The Cruel Prince