Närmare bestämt får han ett kraftfullt, experimentellt läkemedel som heter APTX 4869 av en medlem i Black Organization som heter Gin .
Gin lurade Shinichi att ta drogen samtidigt som han undersökte organisationens verksamhet. Läkemedlet var tänkt att vara ett dödligt gift, men det slog tillbaka och fick Shinichi att krympa istället.