Vad är Jacobsen-index?

Jacobsen-indexet för ett fylogenetiskt träd är ett mått på dess grenighet, eller i vilken grad trädet innehåller korta inre grenar. Det definieras som förhållandet mellan den totala trädlängden (summan av längderna av alla grenar i trädet) och minsta möjliga trädlängd, vilket är längden på ett träd med samma antal taxa och inga inre grenar ( alla taxa är kopplade direkt till roten).

Ett högt Jacobsen-index indikerar ett träd med många korta inre grenar, vilket kan vara resultatet av en snabb utstrålning av taxa eller en hög karaktärsutveckling. Ett lågt Jacobsen-index indikerar ett träd med få korta inre grenar, vilket kan vara resultatet av en långsam utstrålning av taxa eller en låg karaktärsutveckling.

Jacobsen-indexet används ofta för att jämföra den relativa förgreningen av olika fylogenetiska träd, och kan användas för att bedöma anpassningen av olika evolutionära modeller till en given datamängd.