Här är vad vi vet om hans musikaliska produktion:
* Han var främst kyrkomusiker. Det är troligen därför de flesta av hans kompositioner var avsedda för religiösa gudstjänster, såsom kantater, motetter och orgelverk.
* Han tros ha skrivit flera kantater och koraler. Tyvärr har ingen av dessa bevarats.
* Han skrev också några klaviaturstycken. Några av dessa finns fortfarande kvar, inklusive "Allein Gott in der Höh sei Ehr" och "Christ lag in Todesbanden", som anses vara tidiga exempel på barockorgelmusik.
Det är viktigt att komma ihåg att vår kunskap om Johann Christoph Bachs verk är mycket begränsad på grund av bristen på bevarade manuskript. Därför är det omöjligt att ge en heltäckande lista över hans kompositioner.
De bevarade verken ger dock en värdefull inblick i den musikaliska miljö där Johann Sebastian Bach växte upp och påverkades.