Den abstrakta konflikten i berättelsen ligger i Browns interna kamp för att behålla sin tro inför ondskan och korruptionen som han bevittnar i skogen. Han möter figurer som djävulen, som representerar frestelser och synd, såväl som andra skuggiga och mystiska karaktärer som symboliserar de mörkare aspekterna av den mänskliga naturen. Allt eftersom berättelsen fortskrider blir Brown allt mer konfliktfylld och förvirrad och ifrågasätter sin egen rättfärdighet och existensen av absolut gott och ont.
Denna interna konflikt manifesterar sig genom olika möten och möter Browns erfarenheter under sin resa, var och en bidrar till hans växande oro och tvivel. Han måste konfrontera möjligheten att han är kapabel till ondska och att gränsen mellan gott och ont inte är så tydlig som han tidigare hade trott.
Ytterst handlar den abstrakta konflikten i "Young Goodman Brown" om huvudpersonens utforskande av de mörkare aspekterna av den mänskliga naturen, gränserna för hans egen moral och kampen för att behålla tron inför tvivel och frestelser.