* Natur och ekologi: Hundertwasser trodde djupt på människans och naturens sammanlänkning. Hans konst skildrade ofta frodiga landskap, träd och djur, och hyllade den naturliga världens skönhet och bräcklighet.
* Arkitektur: Han såg arkitektur som en form av konst och trodde på att skapa byggnader som smälter sömlöst med naturen, med kurviga linjer, organiska former och mycket grönska. Hans målningar innehöll ofta fantastiska, biomorfa byggnader, vilket lyfte fram hans vision för hållbara och harmoniska stadsmiljöer.
* Spiraler och cirklar: Dessa återkommande motiv symboliserar organisk tillväxt, livscykler och alla tings sammanlänkning. Han använde dem för att skapa en känsla av rörelse och energi i sitt konstverk.
* Färg och struktur: Hundertwasser älskade att använda ljusa, livfulla färger och kontrasterande texturer för att skapa visuellt stimulerande och engagerande kompositioner. Han använde ofta djärva drag och virvlande mönster för att förmedla en känsla av rörelse och liv.
* Antigeometri och antirationalitet: Han förkastade traditionella, stela geometriska former och omfamnade skönheten i oregelbundenhet och spontanitet, vilket speglar hans övertygelse om att konst ska vara ett personligt och intuitivt uttryck.
Utöver dessa teman inkorporerade Hundertwasser också element av filosofi, andlighet och sociala kommentarer in i hans arbete, och behandlar ofta ämnen som miljöism, fred och social rättvisa.